Einfache Visualisierung veröffentlichter Reaktionen in Synthesewegen – SYNTHIA 6.5
In der nächsten Version der SYNTHIA™ Retrosynthesis Software haben Benutzer die Möglichkeit, veröffentlichte Reaktionen in vorhergesagte Stoffwechselwege einzubeziehen. Suchen Sie in Ihren Ergebnissen nach den hellgrünen Knoten, um veröffentlichte Reaktionen einfach zu visualisieren.
Beispiel
Für dieses Beispiel haben wir eine Analyse für das Thyrotropin-Releasing-Hormon (THR) durchgeführt, ein kleines Signalpeptid des zentralen Nervensystems, das als Hilfsmittel bei der Behandlung von Schilddrüsenkrebs eingesetzt wird. Wir haben die allgemeine gespeicherte Konfiguration verwendet, die die genauen veröffentlichten Reaktionen zusammen mit den von Experten codierten Regeln für die vorhergesagte Chemie enthält.
In den Ergebnissen können wir drei Arten von Pfaden finden: einen mit nur veröffentlichten Reaktionen, einen, der vollständig auf Vorhersagereaktionen basiert, und einen, der beide kombiniert.
Weg A – Veröffentlicht
Weg B – Vorausschauend
Weg C – Kombination
Sie finden die Datenbankoptionen in den Analysekonfigurationseinstellungen auf der Registerkarte „Pfadranking“.
Datenbanken können beliebig kombiniert werden. Wählen
- „Chemiker-codierte Reaktionsregeln“ allein für Reaktionswege mit nur vorhersagenden Reaktionen
- „SPRESI by DeepMatter“ allein für Pfade mit nur veröffentlichten Reaktionen
- Beides für eine Mischung aus prädiktiven und veröffentlichten Reaktionen
Zusätzliche maschinell extrahierte Reaktionsregeln sind ebenfalls verfügbar. Sie können verwendet werden, um die von Experten codierten Regeln zu ergänzen, insbesondere wenn Ihre Struktur komplexe aromatische Systeme oder ungewöhnliche Heterocyclen enthält.
