逆合成软件如何加速药物发现?
简介
逆合成软件是现代药物发现的重要催化剂,可加速新分子合成路线的设计。缩短可行合成路线的时间可大大加快候选药物进入临床评估的进程。因此,速度对于药物研发至关重要。过去五年中,人工智能驱动的合成设计工具的应用明显激增,反映出它们在药物化学工作流程中的作用不断扩大。SYNTHIA® 等平台充分体现了先进的逆合成软件是如何改变研发流程的。
快速探索合成路线
高速路线设计
计算机辅助逆向合成工具只需人工规划所需时间的一小部分,就能提出并评估数百种合成策略。通过利用大型反应数据库和高速算法,这些平台可将过去需要数周的头脑风暴压缩至数小时。这种加速的构思过程使项目团队能够快速确定可行的路径,并在最短的时间内将化合物投入合成。
选择范围广
与人类化学家不同,逆合成软件不受记忆或认知偏差的限制。它可以探索各种潜在的断裂点,包括非常规或反直觉策略。因此,软件往往能发现人工规划时可能忽略的步骤更少或产量更高的路线。这种并行探索选项的方式能够快速评估多种合成路线,从而加快从设计到执行的进度。
利用预测分析减少试验和错误
减少死胡同
逆合成软件的关键加速因素之一是它能够及早筛选出不可行的路线。SYNTHIA® 等工具使用编码反应规则和预测模型来评估每种拟议转化的成功可能性。这种内置的分流功能可防止化学家将时间浪费在特性不佳、效率低下或在实际条件下不安全的反应上。
虚拟优化
许多平台都允许进行目标定向合成,在限制条件下优化路线,如尽量减少步骤数、避免使用特定试剂或最大化理论产率。这些约束条件引导算法选择满足特定项目需求的路线。通过在硅学中执行这种优化,化学家们可以在几分钟内反复推敲各种可能性,而无需进行昂贵而耗时的实验测试。
整合设计与合成
无缝流水线集成
逆合成软件连接了分子设计与实验室合成,弥合了构思与执行之间的差距。有些平台可直接与化合物设计工具集成,提供有关拟议分子可合成性的实时反馈。例如,SYNTHIA® 提供 API 集成,可对虚拟化合物库进行无缝评估。这种合成可行性的早期可视性可确保只推进可行的候选化合物,从而简化先导化合物的优化。
同时开发多个靶点
在具有多种活性化合物或类似物的项目中,逆合成工具可以处理所有目标的并行规划。SYNTHIA® 的这一独特功能可同时优化目标化合物库的合成路线,大大缩短了周期时间,使药物化学团队能够同时开发多个候选化合物。因此,工作流程更加灵活,从发现新药到优化新药的时间更短。
提高创造力和解决问题的能力
增强化学家的创新能力
逆合成软件不是取代化学家,而是增强他们的创新能力。该平台可作为合成头脑风暴的合作伙伴,提出非传统的断裂点,化学家可对其进行改进或调整。这种协同方法可加快解决复杂的合成难题,通常只需很短的时间就能产生新的解决方案。
知识的可获取性
逆合成软件编码了丰富的合成知识,使所有用户都能获得专家级的反应规划。例如,SYNTHIA® 集成了数万条经过验证的反应规则,可即时访问庞大的合成策略档案。这种化学专业知识的民主化减少了对文献挖掘或高级咨询的依赖,加快了不同经验水平的路线设计。
案例研究:利用人工智能规划加速原料药合成设计
在最近的一个螺旋酶抑制剂的开发项目中,研究人员利用 SYNTHIA中,研究人员使用 SYNTHIA® 来简化复杂抗病毒靶标的合成过程。该软件提供了多种可行的途径,包括试剂清单和反应条件。这样,研究小组就可以满怀信心地直接进行实验验证。最终路线提高了产率、选择性和可持续性,并减少了迭代次数。这个案例说明了人工智能规划工具如何能够大幅压缩路线考察阶段并提高合成效率。
降低风险,提高成功率
降低风险
通过评估众多选项并标记有问题的步骤,逆合成软件可以帮助团队避开那些存在可扩展性或安全性问题的路线。例如,如果某一途径涉及剧毒试剂,该工具就能提出更安全的替代方案。这种预测性的前瞻性可避免后期阶段的挫折,并支持在开发早期做出更稳健的决策。
更快的迭代
药物发现本身就是动态的,结构修改频繁,优先事项不断变化。逆合成平台可针对新靶点或先导物的修改进行快速重新规划。这一功能使团队能够快速适应,并使合成时间表与不断变化的项目需求保持一致。
结束语
逆合成软件已成为加速药物发现的战略资产。SYNTHIA® 等平台能够快速生成路线,将精力集中在可行的计划上,并与分子设计无缝集成,从而缩短了从分子构思到实验室实现的时间。这种加速贯穿了从合成到放大的整个流程,最终加快了治疗药物的交付。在这个分秒必争的领域,采用人工智能辅助逆合成不仅代表着技术进步,也是实现高效创新的竞争要务。
参考文献
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