Memberdayakan Penemuan Obat
Bagaimana AIDDISON™ dan SYNTHIA® Mengubah Desain Molekuler

Pendahuluan

Dalam lanskap Penemuan Obat yang terus berkembang, integrasi Kecerdasan Buatan (AI), pembelajaran mesin (ML), dan kimiaformatika merevolusi cara para ilmuwan melakukan pendekatan terhadap desain dan sintesis molekul baru. Dua platform-AIDDISON™ dan SYNTHIA®-sekarang bekerja sama untuk mempercepat dan mengurangi risiko proses R&D Kimia, mulai dari ide hingga sintesis.

 

Tantangan "Apa yang Harus Dibuat" dan "Bagaimana Membuatnya"

Penemuan obat dapat disaring menjadi dua pertanyaan mendasar:

  • Apa yang harus dibuat? (Ide, desain, dan pemilihan molekul yang menjanjikan)
  • Bagaimana cara membuatnya? (Perencanaan sintesis yang praktis, efisien, dan terukur)

AIDDISON™ dan SYNTHIA® memberikan jawaban yang mulus dan terintegrasi untuk keduanya.

 

AIDDISON™: Memecahkan "Apa yang Harus Dibuat"

AIDDISON™ adalah platform SaaS berbasis web dengan AI yang memberdayakan ahli kimia obat dan komputasi untuk menjelajahi ruang kimia yang luas, menghasilkan molekul baru, dan memprioritaskan kandidat dengan profil biologis dan ADMET (penyerapan, distribusi, metabolisme, ekskresi, toksisitas) yang optimal. Antarmuka yang intuitif dan mesin komputasi yang kuat memungkinkan pengguna untuk:

  • Melakukan pencarian kemiripan dan farmakofor di seluruh basis data publik dan kepemilikan
  • Menggunakan model AI generatif untuk desain molekuler de novo
  • Menerapkan filter properti berbasis ML dan prediksi ADMET
  • Melakukan penyelarasan berbasis bentuk dan penambatan molekuler untuk penilaian keterlibatan target
  • Mengelompokkan dan memfilter pustaka yang besar untuk fokus pada prospek yang paling menjanjikan

 

SYNTHIA®: Memecahkan "Bagaimana Cara Membuat"

Setelah AIDDISON™ mengidentifikasi molekul yang menjanjikan, Perangkat Lunak Retrosintesis SYNTHIA® mengambil alih untuk menjawab pertanyaan "bagaimana cara membuatnya". SYNTHIA® menggunakan aturan kimia yang dikodekan oleh para ahli dan basis data lebih dari 14 juta bahan penyusun yang tersedia secara komersial:

  • Menghasilkan dan memberi peringkat rute sintetis dengan cepat untuk setiap molekul target
  • Menilai aksesibilitas dan kompleksitas sintetis (skor SAS)
  • Menyediakan langkah-langkah reaksi terperinci, referensi, dan sumber komersial untuk bahan awal
  • Mendukung Kimia Ramah Lingkungan dengan mengoptimalkan penghematan atom dan meminimalkan reagen berbahaya
  • Memungkinkan Analisis Bertahap dan integrasi dengan alat kimia lain melalui API

 

Kekuatan Integrasi: AIDDISON™ + SYNTHIA®

Kekuatan yang sebenarnya muncul ketika platform ini digunakan bersama-sama. AIDDISON™ dapat mengirimkan molekul-molekul terbaiknya yang dirancang oleh AI secara langsung ke SYNTHIA® untuk analisis retrosintesis. Integrasi ini memungkinkan pengguna untuk:

  • Menilai secara instan apakah hit virtual dapat diakses secara sintetis
  • Memprioritaskan molekul tidak hanya untuk aktivitas yang diprediksi, tetapi untuk kelayakan dunia nyata
  • Menghasilkan Daftar Belanja untuk reagen dan bahan awal, merampingkan pengadaan
  • Menjembatani kesenjangan antara desain virtual dan realitas laboratorium

Studi Kasus: Penghambat Tankyrase

Sebuah studi kasus baru-baru ini mencontohkan alur kerja ini. Dimulai dari inhibitor tankyrase yang diketahui, AIDDISON™ menghasilkan serangkaian analog yang beragam menggunakan model generatif dan penyaringan virtual. Kandidat-kandidat ini disaring untuk properti ADMET dan dipasangkan ke protein target. Struktur yang paling menjanjikan kemudian dikirim ke SYNTHIA® untuk analisis retrosintetik, memastikan bahwa hanya prospek yang dapat diakses secara sintetis yang dapat dilanjutkan ke tahap berikutnya. Pendekatan ini mempercepat identifikasi kandidat obat baru yang layak dan memungkinkan eksplorasi ruang kimia yang lebih menyeluruh daripada metode tradisional saja.

 

Sorotan Catatan Aplikasi: "AIDDISON: Memberdayakan Penemuan Obat dengan Alat AI / ML dan CADD dalam Platform SaaS Berbasis Web yang Aman"

Catatan Aplikasi radikal, "AIDDISON: Memberdayakan Penemuan Obat dengan Alat AI / ML dan CADD dalam Platform SaaS Berbasis Web yang Aman" oleh Rusinko dkk., diterbitkan dalam Jurnal Informasi dan Pemodelan Kimia pada tahun 2024. Publikasi ini merinci arsitektur, alur kerja, dan dampak dunia nyata AIDDISON™, termasuk integrasinya dengan SYNTHIA®.

Poin-poin penting dari Catatan Aplikasi:

  • Keamanan & Aksesibilitas: AIDDISON™ memiliki sertifikasi ISO 27001, memastikan pengamanan data dan kepatuhan data untuk proyek-proyek R&D yang sensitif.
  • Alur Kerja dari Ujung ke Ujung: Platform ini mencakup segala hal mulai dari penyaringan virtual dan prediksi ADMET hingga kelayakan dan pengadaan sintetis.
  • Desain yang Berpusat pada Pengguna: Antarmuka yang intuitif menurunkan penghalang bagi yang bukan ahli, mendemokratisasi akses ke alat penemuan obat komputasi canggih.
  • Integrasi dengan SYNTHIA®: Perpindahan tanpa batas ke SYNTHIA® memungkinkan analisis retrosintesis langsung, menutup lingkaran dari "apa yang harus dibuat" menjadi "bagaimana cara membuatnya."

Baca Catatan Aplikasi selengkapnya:
BANTUAN: Memberdayakan Cakram Obat...

 

Bagi pengguna SYNTHIA®, mengadopsi AIDDISON™ berarti:

  • Inovasi Lebih Cepat: Menghasilkan, menyaring, dan memprioritaskan Molekul Baru dengan cepat sebelum Perencanaan Sintesis.
  • Proyek yang tidak berisiko: Fokuskan sumber pada molekul yang menjanjikan secara biologis dan layak secara sintetis.
  • Alur Kerja yang Efisien: Bergerak dengan mulus dari desain virtual ke rencana sintesis yang dapat ditindaklanjuti, semuanya dalam lingkungan berbasis cloud yang aman.
  • Kekuatan Kolaboratif: Berbagi proyek, analisis, dan wawasan di seluruh tim, menjembatani kesenjangan antara ahli kimia komputasi dan ahli kimia bangku.

Kombinasi AIDDISON™ dan SYNTHIA® mewakili pergeseran paradigma dalam penemuan obat. Dengan menyatukan langkah "apa yang harus dibuat" dan "bagaimana membuat" dalam satu alur kerja, platform ini memberdayakan ahli kimia untuk berinovasi dengan percaya diri, mempercepat jadwal, dan membawa terapi baru ke pasar dengan lebih efisien daripada sebelumnya.

 

Pelajari Lebih Lanjut: Webinar Sesuai Permintaan

Bagi mereka yang tertarik untuk melihat konsep-konsep ini dalam tindakan, kami merekomendasikan webinar baru-baru ini:

Menggunakan AI dan Retrosintesis untuk Menyederhanakan Penemuan Molekul Kecil
Dipersembahkan pada KTT Digital Perangkat Lunak AI & Lab oleh Manajer Lab

Sesi ini menampilkan fitur studi kasus retrospektif yang menunjukkan bagaimana molekul kecil yang dipublikasikan, yang awalnya ditemukan melalui metode tradisional, dapat diidentifikasi secara lebih efisien menggunakan pendekatan in silico sepenuhnya. Para pemateri akan membahas siklus Desain-Membuat-Tes-Menganalisis (DMTA) digital terintegrasi menggunakan AIDDISON™ untuk desain molekul generatif dan pemodelan ADMET prediktif, dan SYNTHIA® untuk perencanaan sintesis retrosintesis dan perpustakaan. Alur kerja ini menunjukkan bagaimana AI dan alat digital memungkinkan pengambilan keputusan yang lebih cepat, penentuan prioritas senyawa yang lebih baik, dan penyelarasan yang lebih dekat antara desain dan sintesis.

Tujuan Pembelajaran Utama:

  • Meningkatkan hit-to-lead dan pengoptimalan kandidat dengan alur kerja digital yang terintegrasi
  • Menghasilkan pustaka molekul yang beragam dengan sifat seperti obat yang diinginkan
  • Menyempurnakan desain de novo untuk kelayakan dunia nyata dan kecepatan sintesis menggunakan perencanaan sintesis retrosintetik dan sintesis maju

Pembicara

  • Suhasini M Iyengar, Ph.D. (Ilmuwan Aplikasi dan Penemuan AIDDISON™)
  • Emma Gardener, Ph.D. (Ilmuwan Aplikasi Teknis, SYNTHIA®)

Tonton webinarnya:
Menggunakan AI dan Retrosintesis untuk...

Webinar ini memberikan wawasan praktis dan contoh dunia nyata tentang bagaimana AIDDISON™ dan SYNTHIA® dapat dimanfaatkan bersama untuk meningkatkan penemuan tahap awal dan meningkatkan efisiensi R&D molekul kecil.

 

Siap untuk mengubah alur kerja Anda?
Jelajahi SYNTHIA® lebih lanjut di sini dan AIDDISON™ di digitalchemistry.ai

 

Referensi:

  • Rusinko, A., Rezaei, M., Friedrich, L., Buchstaller, H.-P., Kuhn, D., & Ghogare, A. (2024). AIDDISON: Memberdayakan Penemuan Obat dengan Alat AI / ML dan CADD dalam Platform SaaS Berbasis Web yang Aman. Jurnal Informasi dan Pemodelan Kimia, 64(1), 3-8. DOI: 10.1021/acs.jcim.3c01016.

Siap menambahkan verifikasi digital ke alur kerja Anda?

Jelajahi ChemisTwin™ dan dunia bahan referensi digital

Sigma-Aldrich ChemisTwin™ Platfom